蒜种选择是大蒜优质高产的重要步骤之一，首先在田间生长时，进行株选，选择具有本品种形态特征的植株，而且叶片无病斑；收获时进行蒜头选择，选择大而规整、蒜头外皮颜色一致、无病斑、无伤口、无散瓣、蒜瓣肥大、蒜衣色泽一致的具有本品种特征特性的蒜头；播种前先掰瓣，选择无病、无霉变、无机械损伤或虫蛀的蒜头进行掰瓣，然后选择种瓣，剔除夹瓣和霉烂虫蛀、破碎的蒜瓣。
实践证明，大蒜生长和产量与种瓣的大小有密切关系，大瓣蒜种内含营养物质多，播种后出苗粗壮，生长速度快，长成的植株高大，蒜薹粗壮，蒜头产量高；而小瓣蒜出苗细弱，生长较慢，叶片窄，即使多施肥也难以达到大瓣蒜种的幼苗生长速度，因而严量较低。但是大瓣蒜种的用种量大，投入多，成本较高。同时，在不同栽培管理条件下，种瓣大小与大蒜二次生长有一定关系。
因此，生产中应根据栽培管理条件及对收获产品的要求选择种瓣，可选择大小适合的种瓣，进行分级分开播种，以利植株生长整齐一致，方便栽培管理。