辣椒根系对于辣椒来说是非常重要的，是辣椒生长的基础和根本。辣椒根系所吸收的营养，占到整个辣椒所需营养的80%以上。根部生长的好，扎根越深，才能起到固定作用，也能够产生辣椒体内五大内源激素，比如说分裂素、赤霉素、乙酸、脱落酸等。
辣椒属于浅根性辣椒，辣椒根系发育比较偏弱，木栓化程度偏高。再加上其再生能力差，根须量少。不容易发生不定根，辣椒根系不发达，不耐旱、怕涝，对于土壤当中的养分需求比较高。所以好辣椒根系决定着辣椒的产量和效益。
一、辣椒根系的作用
1.从土壤中吸收水分及无机营养，植株生长发育所需要的水分和无机营养都是由根从土壤中吸收的。
2.合成氨基酸，植物所必需的许多氨基酸是由根系合成后输送到地上部分的。
3.根还起固定植株、支持主茎、防止植株倒伏的作用。
二、辣椒根系的特性
1. 辣椒根系由主根、侧根、支根及毛根组成。辣椒的主根上粗下细，在疏松的土壤里一般可入土40－50厘米。育苗移栽的辣椒，由于主根被切断，生长受到抑制，深度一般为20－30厘米。侧根从主根和根茎部长出，侧根生长早而多，主要分布在10－20厘米处。
2.辣椒根系不发达，根数量少，主根比较粗，辣椒根系生长速度慢，在长出2－3片真叶时才长出较多的二次侧根。如果根受伤，再生能力较差。
3.根的吸收作用主要由幼嫩的根和根毛进行。合成作用主要在新生根的细胞中进行。较老的木栓化根只能通过皮孔吸水，且吸收量少。
在辣椒根部的最前端有1－2厘米左右处是辣椒的根毛区，上面密密麻麻生长着很多根毛，但根毛寿命比较短，只有几天时间，但因其密度大、吸水能力强且有力，是辣椒根系中吸收最活跃的部分。由于辣椒生长所需要的水分，主要依靠嫩的根和根毛皮，因此，在栽培中尽量保证辣椒能够不断地发生新根和长出根毛。
4.根系对氧需求严格，不耐涝，不耐旱，不耐土壤高盐分浓度，所以栽培辣椒必须选择土质疏松肥沃，透气性良好的土壤。
5.根系的吸收能力差，若土壤中水分不足，会造成吸水困难，所以不耐旱；因对氧要求严格，土壤水分太多造成氧缺少，淹水数小时会造成缺氧而涝死。
三、种植技术
1.保证在移栽时尽量不伤辣椒根系，利于缓苗。培育壮苗，防止幼苗徒长，并且定植的苗龄不能过大，防止老化形成木栓组织，很难再生根。
2.辣椒移栽后一周内，由于幼苗需迅速长出新根，应保持较高的土壤水分含量（约相当于田间最大持水量的80%）。此后土壤见干见湿，保持土壤含水量相当于田间最大持水量的50%－80％。进入座果期可适当提高土壤湿度，但不应超过田间最大持水量的80％。
3.可以通过药剂蘸根，达到促进辣椒根系生长的目的。可以使植农增产素进行蘸根。蘸根前先把幼苗放入棚内适应2天，蘸根后凉一段时间后再定植，保证植株对药剂的充分吸收。
4. “辣椒根系不发达，根量少，入土浅”在陆地栽培时，种植面积不能太小，种植的密度也不能稀疏，由于辣椒根系不发达，很容易倒伏。大棚里多栽培“无限生长型品种”这种辣椒可以长得很高，所以必须用绳子牵引生长。
5.由于“根量少，入土浅”，辣椒的施肥多以后期冲施肥兑水冲施为主，底肥施得太深，辣椒辣椒根系够不到，施得太浅，又不容易分解，还会烧根。
6.“入土浅”的特点，浇水方面需要勤浇少浇。以大棚无限生长品种为例，生育期大概180天，需要5－7天冲施肥料一次，以氮磷钾复合型腐殖酸水溶肥为主，。
7.“再生能力弱，不易发生不定根”辣椒如果发生了根部病虫害，将会对产量影响很大，针对这个特点，我们需要对辣椒根部病虫害提前的防治，主要预防“青枯病，枯萎病，根结线虫”。
