大蒜收获时已进入自然休眠期，外部鳞片逐渐形成干膜，有防止内部水分蒸发的作用，即使环境条件适合也不会发芽。但宜贮藏在通风、干燥环境下，以防止发生霉变、腐烂。大蒜的休眠期通常为2～3个月。
低温低湿有利于大蒜进入休眠期，有利于贮藏。大蒜头最适宜的贮藏温度为0℃左右。大蒜经过休眠期后，温度高于5℃时易发芽。发芽消耗养分，使肉质变软，水分减少，蒜瓣干瘪，致使大蒜商品性下降。为延长大蒜休眠期，可在大蒜休眠期结束前8000～10000德60y射线辐射处理蒜头，使大蒜休眠期延至4～6个月。如温湿度控制好，平放在冷库贮藏架上或塑料大帐内贮藏，利用自然降氧法降氧，可安全休眠6～10个月。
将蒜头晒干后，留2～3厘米假茎，堆在贮藏库货架上，或置于木箱、菜筐、塑料箱内，骑马式堆在通风库内，保持通风、凉爽、低温、干燥即可。
目前大蒜产区的蒜农以挂藏和架藏法较多。
挂藏法一般蒜头不易腐烂，质量好，方法简单易行。大蒜收获后在通风干燥处摊开，晾晒2～4天，促进蒜头和茎叶迅速干燥，进入休眠状态。晾晒过程中避免雨淋。
晾干的大蒜，经过挑选，去除机械伤、腐烂及有病虫害的蒜头，编成辫。放在临时凉棚、冷凉室内或者通风贮藏库内，冬季移入通风贮藏库内。也可将蒜头假茎用镀锌铁丝串起来，悬挂在屋檐下，使蒜头自然风干。
架藏法将晾干后的大蒜编成辫，在通风、干燥的室内设置木制或竹制架梯，架梯上有间距较大的横隔，将蒜辫跨挂在横隔上，辫间留有空隙，以利通风。
贮藏前期每隔3～5天翻动一次，及时剔除腐烂的蒜头，注意通风避湿。