一、土壤酸化
因蒜农不注重土壤健康，片面追求产量而不合理用肥导致土壤酸化，土壤酸化会造成土壤微生物群落发生改变，有害微生物数量超过有益微生物数量，引发土传病害（如根腐、茎腐等）；其次土壤酸化使根系生长受抑制，根系生长障碍会导致养分吸收受阻，致使肥料残留越来越多，使土壤进一步恶化。
二、追肥不合理
蒜农感觉植株长势不旺，前期追施尿素或尿素+平衡型复合肥来催苗，后期追施尿素+钾肥来催薹。这样的追肥习惯不仅导致土壤酸化加重，同时催出来的植株抗性很差。
抗性差有以下表现：一是在12月份和次年1月份遇到低温时，极易发生冻害，使植株严重受创，待气温回升时病害又会多发；
二是尿素催出来的植株在灌水或遇到低温时，下部叶片容易发枯发黄，不仅不能进行光合作用，而且呼吸作用会不断消耗植株积累的养分，进一步降低植株抗性。
此外许多蒜农追肥次数高到4-5次，后期植株较大封行后，追肥时很多肥料撒到叶子上，造成烧叶等肥害。
三、病害预防不及时
很多蒜农没有预防病害的意识，到大蒜发生明显病害后才想到喷药，更糟的是蒜农去到农资店购农药时，买回来的往往是一些营养液或没有治疗病害的药剂，导致用药后也不起作用。发病严重的植株就会慢慢枯死，如遇疫病病害还会快速传染扩散，造成严重损失。
