湿润育苗湿润的环境、适宜的温度、充足的光照、丰富的营养物质等导致育苗盘 (苗盘和水盘) 的水盘中和苗盘表面滋生绿藻，影响烟苗质量。绿藻防控不当就会对烟苗造成二次伤害，影响烟叶质量安全。
一、水的因素
水是绿藻生长必需的条件之一，水分给绿藻生存提供了良好的生长环境。育苗水源不干净，绿藻就会快速繁殖和狂长。
二、光的因素
光也是绿藻生长必需的条件之一。绿藻极易在育苗基质表面及水盘中滋生。
三、温度因素
绿藻是喜温生物，水温对绿藻生长具有重要影响，其各种生理活动及生化反应都必须在一定的温度下才能进行。烟苗生长发育最适宜温度为25～28℃，与绿藻繁殖的最适宜温度极其相近。在25～30℃时，有利于绿藻生长繁殖，这也说明，温度过低或过高时会引起其他因子的变化，如酶的活性、pH值。这些环境因子的变化又能影响绿藻的生长发育，所以都不利于藻类的生长
四、肥料因素
在营养元素中，造成育苗盘中绿藻生长的主要因子是氮磷。营养液用量过多，导致育苗盘中氮肥和磷肥的浓度超标即水体富营养化，产生绿藻。氮磷比在(5～10):1比较适宜绿藻的生长繁殖。
五、pH值因素
在pH值8.0～9.5的淡水中，pH值8.5时藻类生长状况最好，pH值9.5时生长最差。水体中pH值在8.5时，绿藻的生长繁殖能力最强;pH值在7.5以下藻类的增殖能力随着pH值的降低而逐渐减弱。因此，藻类适宜在弱碱性条件下生长。
烤烟对土壤酸碱度的适应性极强，在pH值为3.5～9.0的土壤上均能正常生长，且完成生命周期循环。土壤pH值的高低直接影响烟草生长发育，pH值过高(＞9.0)或过低(＜4.0)时，对烟株根部有损害，影响根部的吸收功能;同时也制约营养元素的形态及其土壤中的浓度
六、人为因素
一般烟农使用的育苗盘需要反复使用3～5a。育苗盘重复利用时，孔穴内外都会遗留残藻。清洗不干净，消毒不彻底，残藻就会乘虚而入。人工或装盘播种机在基质装盘时装得过于紧实，基质吸水过多，湿度增加，绿藻大量繁殖。苗盘和水盘虽是标配，但年久走型，导致苗盘和水盘之间留有不同程度的空隙。营养液见光后，极易造成绿藻大发生。育苗棚不按时通风，也有利于绿藻发生。