坚持预防为主，综合防治的原则。育苗大棚内禁止吸烟，进行各项农事操作前用肥皂水洗手，以防止病害的传播，特别是病毒病的传播蔓延。在严格按照卫生操作的同时，一定要结合必要的药剂防治，一般在育苗过程中，进行间苗或剪叶等农事操作前，要喷施1次病毒病防治药剂，做到带药操作，移栽前喷施一次病毒病防治药剂，做到带药移栽，病毒病防治药课桌可选择毒必克、菌克毒清等。
在苗床管理过程中，如发现苗床出现猝倒病、根黑腐病等真菌性病害时，应及时拔除病株，并带出棚外集中处理，同时喷药进行防治，药剂可选择甲基托面津或黑达等。
在进行药剂防治时，药液浓度应严格按照药剂使用说明书进行配置。
在具体育苗中应严格遵循“苗床卫生保健为主，药剂防治为辅”的原则，重视育苗环境和育苗操作的卫生，发现病害及时防治。
①苗床卫生措施：严禁非工作人员进入棚内，进入棚内的人员需用肥皂水洗手；操作人员严禁在棚内吸烟，不得在育苗池中洗手；修剪烟苗或间苗时，工具须用肥皂液浸泡消毒，修剪掉的和间苗剩下的余苗应及时清理出棚外；在开门通风或炼苗过程中要注意防治蚜虫等害虫；苗床出现病株时，应及时拔除，并对症下药。
②育苗场地四周环境的维护。育苗场地四周环境是病虫害传播的主要场所，所以育苗场地四周环境是湿润育苗病虫害防治的关键。一般维护措施是：保证育苗拱棚20米内无堆捂的粪堆；定期铲除拱棚四周及排水沟边的杂草并进行药剂消毒，一般用90的敌百虫原药600倍液和25多菌灵300倍液分别喷洒2～3次即可。