多芽嫁接，既可防治根结线虫、青枯病，又可降低用种成本1/3至1/2，进一步拓宽了番茄嫁接技术的应用范围。具体做法有以下三种。
一、在接穗和砧木苗生长至5～6片完全真叶时，砧木留基部2片真叶去顶，接穗留顶部2叶1心切取，进行劈接拔除接穗苗床内的杂草、病苗，并施肥1～2次，促进腋芽生长。在一般条件下，10～15天后腋芽达到接穗标准，再切取嫁接，将腋芽培育成结果主秆。采取该方法，砧木要分两批播种，接穗可利用主芽和腋芽1～2个，即嫁接育成2～3株生产用苗。使会果
二、砧木与接穗同时或砧木比接穗提前1～3天播种，当砧木具6叶1心时，用上述劈接法完成接穗顶芽嫁接，再切取上部1～2段带有1片完好叶片约5厘米长的嫩茎进嫁接，使潜伏腋芽在嫁接后萌生并成长为结果主秆。