番茄水插育苗一般从插条长成7～8片叶的大苗只需18～20天，培育667平方米番茄大田所需秧苗（约3000株）仅需育苗面积4平方米，比常规育苗移栽所需苗床面积少10倍，另外还能加快良种繁育速度，促进良种的推广普及。其具体做法如下。
（1）插条的选择和整理
从生长健壮并具有品种特性的植株上选择侧枝，切成8～10厘米小段、切口要平整光滑，并将下部3～4厘米内的叶片剪去，集中放入室内，待切口自然干燥愈合后即可用作水插插条。将番茄插条插入生根液中待其发根后，再用营养液培养，便可育成健壮秧苗。
（2）生根液的配制将1克吲哚乙酸粉剂放入小杯中，加入少量酒精，待其溶解后倒入盛有5升清水的容器中，即为200毫克/千克噪乙酸原液水插番茄插条时，量取升原液并倒入盛有10升清水的容器内搅匀，即成为水用的生根液
（3）营养液的配制
取硝酸钾10.2克，硝酸钙4.9克，西磷酸二氢钾2.3克，硫酸镁4.9克，分别用少量水溶解，然后依次倒入盛有10升清水的容器内搅匀，即制成水插苗所需的营养液，配制时注意硫酸镁液要最后倒入容器内，以免发生沉淀
（4）水插容器的准备
水插容器可用容积为500毫升的广口瓶，瓶底填放直径为1～2厘米的碎石块，用以固定插条每瓶插10～12条番茄侧枝。水插容器均需清洗干净，并用沸水消毒。
（5）水插育苗的管理
番茄水插育苗场地可根据各地的条件，采用日光温室、塑料大棚或小拱棚。插条插入广口瓶后，将广口瓶排放在育苗床上，室内温度白天保持在22℃～28℃，夜间保持在15℃～20℃每隔1～2天加水1次，补充容器中蒸发的水分。由于育苗室内温度高、湿度大，容易引起插条发病，应每隔2～3天喷洒代森锌500倍液1次，以防止早疫病的发生。一般插条培养5～7天即可发根，可将容器中的生根液倒去并换入营养液供给充足养分。发根后的插条在营养液中培养2周后即长成根系发达、可供定植的健壮番茄苗