烤烟移栽至团棵期的虫害主要有蝼蛄、金针虫、地老虎、蛞蝓、烟蚜、烟蛀茎蛾、烟潜叶蛾、大灰象等，烟夜蛾和棉铃虫出现较晚。这个时期是烟蚜从越冬寄主向烟田迁飞盛期，因此烟蚜防治是主要工作。防止烟蚜传播病毒。
一、烤烟移栽至团棵期的虫害综合防治方法
1.合理轮作，北方烟草与小麦、谷子等轮作为好，南方则烟草与水稻轮作为好。
2.起垄前浅耕、细除草，以杀灭地老虎、金针虫等的幼虫。
3.尽量做到少用或晚用喷雾法，借以保护天敌，使其发挥自然抑制作用。
二、烤烟移栽至团棵期食根害虫的防治方法
1.移栽时施药
每公顷用75％辛硫磷乳油45～600mL加适量水，喷拌于300kg细土上，顺烟垄撒施于移栽穴内，然后移栽。如与硫酸亚铁（黑矾）一起施用能够增效。或者在移栽后喷药，每公顷用5％氯氰菊酯乳油150mL兑水750kg，对准烟苗基部和周围均匀喷雾，以喷湿地表为准。覆盖地膜的烟田，需在盖膜前施药。还应注意在地边用药，使烟田周围形成保护带，以防止田边地头杂草中的地老虎等害虫迁入。
2.防治地老虎
a.3龄前幼虫每公顷用5％高效氯氟氰菊酯微乳剂150g或5％氯氰菊酯乳油112.5～150.0g，兑水稀释后喷施。
b.防治4龄后幼虫主要是施毒饵，发现烟苗受害时，用90％敌百虫0.5kg加水2.5～5.0kg，喷在50g碾碎炒香的棉籽饼或菜籽饼或麦麸上制成毒饵，或用2.5％敌百虫0.5kg拌切碎的鲜青草10～35kg，制成毒草。将毒饵或毒草于傍晚撒到烟苗根际附近。毒饵或毒草用量为每公顷22.5～37.5kg。这种方法主要是针对错过防治适期的4龄以上幼虫的补救措施。
3.灯光诱杀成虫
烟田设置频振式杀虫灯或黑光灯，诱杀地老虎成虫以及蝼蛄、烟夜蛾、棉铃虫、斜纹夜蛾等的成虫。
4.人工捕捉
移栽至还苗期，每天早晨检查烟株，发现烟株折断或倒伏时，扒开烟株周围的土壤捕捉地老虎幼虫。
三、烤烟移栽至团棵期烟蚜的防治方法
1.早春治蚜如果烟田周围有桃树、油菜等烟蚜寄主，在烟蚜卵孵化后，在桃树等烟蚜寄主上喷施10％吡虫啉可湿性粉剂药液，以减少迁入烟田的蚜虫数量。
2.覆盖地膜在烟田覆盖银色塑料薄膜，驱斥有翅蚜降落。
3.移栽时施药于移栽时每公顷用2％的吡虫啉颗粒剂6.75～9.75kg，毒土法穴施。
4.黄色板诱蚜每公顷置300～450块黄色粘虫板，诱杀有翅迁移蚜。
5.迁飞期施药烟蚜向烟田迁飞的高峰期或田间蚜量上升阶段，选用以下药剂兑水喷雾:50％抗蚜威水分散粒剂、10％吡虫啉6可湿性粉剂、25％吡蚜酮可湿性粉剂。
6.释放烟蚜茧蜂
有条件的地方，于烟田烟蚜发生始盛期，逐次放蜂（一般3次以上）治蚜。
四、烤烟移栽至团棵期烟潜叶蛾的防治方法
1.冬季深耕灭烟茬消灭越冬虫
2.移栽时要剔除有虫苗；
3.结合中耕、培土等管理措施及时摘除有虫叶；
4.卵孵化盛期至幼虫龄期喷药防治，25g/L高效氯氟氰菊酯乳油每公顷300～375mL兑水喷雾；
5.用雌性信息素诱芯诱集雄蛾，同时还可观测成虫发生动态，以判定施药适期
五、烤烟移栽至团棵期烟蛀茎蛾的防治方法
1.及时、彻底处理上一年的烟秆、残株，以杀死藏匿于其中的幼虫和蛹；
2.烟田早耕、深耕；
3.苗床内结合间苗、除草拔除虫苗，移栽时选用壮苗，勿用虫苗；
4.于产卵盛期烟茎尚未出现肿胀之前，每公顷用4.5％高效氯氰菊酯乳油337.5～555.0mL兑水喷雾。
六、烤烟移栽至团棵期蛞蝓和蜗牛的防治方法
1.采取农业防治措施具体做法
①春季深翻土壤20～30cm深，灭蜗效果良好。
②中耕，因为蜗牛卵暴露于大气中17h可全部爆裂死亡，阳光直射时5h会全部死亡因此中耕（深20cm）杀卵效果好，对成贝及幼贝也有一定的杀伤效果。
③田间开挖排水沟，降低土壤湿度。
④结合农事活动人工捕捉。具的类食
2.使用杀螺剂
①6％四聚乙醛颗粒剂，用豆饼或玉米粉配制成含四聚乙醛2.5％～6.0％的毒饵，于傍晚将毒饵撒施在烟苗附近地面上。
②每公顷用6％四聚乙醛颗粒剂6～9kg或5％四聚乙醛颗粒剂7.5～9.75kg均匀撒于地面，对蜗牛、蛞蝓有诱集和杀灭作用。每公顷用6％聚醛·甲萘威毒饵（四聚乙醛4.5％与甲萘威1.5％混合物）9.75～10.50kg撒施。
七、烤烟移栽至团棵期其他害虫的防治方法
1.对大灰象可人工捕杀。
2.对网目拟步甲等拟步甲类，发现近地面烟叶有缺刻或烟株地下部分受害时，在烟株近地面的周围捕捉成虫和幼虫。或每公顷用5％高效氯氟氰菊酯微乳剂150g兑水喷雾或灌根。
3.斑须蝽、稻绿蝽等食烟蝽类，可采用人工捕杀方法，必要时用10％吡虫啉可湿性粉剂等（也适用于防治蓟马）。
4.防治烟蚜所用的药剂在若虫期喷雾。